Το κακάο εισήχθη στο Σάο Τομέ από τους Πορτογάλους τον 17ο αιώνα, ενώ το αρχιπέλαγος θεωρούνταν ο μεγαλύτερος παραγωγός κακάο στον κόσμο στα τέλη του 19ου αιώνα. Το προϊόν αυτό αποτέλεσε για πολλά χρόνια την κινητήρια δύναμη της οικονομίας της περιοχής. Τέσσερις δεκαετίες μετά την ανεξαρτησία, το κακάο αναδείχθηκε ξανά, παρουσιάζοντας λεπτό άρωμα. Η περιοχή παράγει κυρίως την ποικιλία αμελονάντο, αλλά διαθέτει επίσης ορισμένες ποικιλίες κακάο τρινιτάριο με ενδιαφέρον ως προς τη λεπτότητα, το άρωμα και τη γεύση.
